قال القيادي الإسلامي، أمين حسن عمر، يجب محاكمة رئيس مجلس السيادة، عبد الفتاح البرهان؛ لأنه نفذ انقلاباً عسكرياً، وأضاف طبقا لـ(السوداني)، إن كان الانقلاب مهما تكن دواعيه جريمة فلم لا يحاكم، ألم يقم بانقلاب على السلطة المنتخبة من الشعب التي أقسم على حمايتها؟”. وقال إن التوقيع الثنائي لرئيس مجلس السيادة ونائبه في الاتفاق الإطاري يدل على أن المكون العسكري ليس طرفاً واحداً، والطبيعي أن المؤسسة العسكرية لا يمكن أن يكون لها قيادة ثنائية، ويجب أن يكون لها توقيع واحد، وهذا يدل على أن هناك اختلافاً في القيادة أو عليها، وأن الطرف الأدنى لا يثق في الطرف الأعلى.
